Wiele genetycznych loci dla gęstości mineralnej kości i złamań

Gęstość mineralna kości wpływa na ryzyko osteoporozy w późniejszym okresie życia i jest przydatna w ocenie ryzyka złamania. Naszym celem było zidentyfikowanie wariantów sekwencji związanych z gęstością mineralną kości i złamaniem. Metody
Przeprowadziliśmy analizę ilościową cech danych pochodzących od 5861 osób z Islandii (zestaw odkrycia), testując związek między 301019 polimorfizmów pojedynczych nukleotydów (SNP) a gęstością mineralną kości kręgosłupa biodrowego i lędźwiowego. Następnie przebadaliśmy pod kątem związku między 74 SNP (z których większość była zamieszana w zestaw do odkrycia) w 32 loci w zestawach replikacyjnych z islandzkich, duńskich i australijskich podmiotów (odpowiednio 4165, 2269 i 1491 osób).
Wyniki
Warianty sekwencji w pięciu regionach genomowych były istotnie związane z gęstością mineralną kości w zbiorze odkrycia i zostały potwierdzone w zestawach replikacyjnych (połączone wartości P, 1,2 x 10-7 do 2,0 x 10-21). Trzy regiony znajdują się blisko lub w obrębie genów, które wcześniej okazały się ważne dla biologicznej charakterystyki kości: aktywator receptora jądrowego genu ligandu czynnika .B (RANKL) (lokalizacja chromosomu, 13q14), genu osteoprotegeryny (OPG) (8q24), oraz gen receptora estrogenu (ESR1) (6q25). Dwa inne regiony są zbliżone do palca cynkowego i domeny BTB zawierającej 40 genów (ZBTB40) (1 p36) i głównego kompleksu kompleksu tkankowego (6p21). Loci 1p36, 8q24 i 6p21 były również związane ze złamaniami osteoporotycznymi, podobnie jak loci w 18q21, w pobliżu aktywatora receptora jądrowego genu czynnika .B (RANK) i loci w 2p16 i 11p11.
Wnioski
Odkryliśmy wspólne warianty sekwencji, które są konsekwentnie związane z gęstością mineralną kości i złamaniami o niskiej urazowości w trzech populacjach pochodzenia europejskiego. Chociaż same te warianty nie są klinicznie użyteczne w prognozowaniu ryzyka dla indywidualnej osoby, zapewniają wgląd w biochemiczne ścieżki leżące u podstaw osteoporozy.
Wprowadzenie
Osteoporoza powoduje istotną zachorowalność i śmiertelność oraz związane z tym koszty i predysponuje ludzi do złamań w biodrach, kręgosłupie, przedramieniu lub innych miejscach szkieletu.1 Jest to powszechna choroba dotykająca obie płcie w populacjach różnych przodków, chociaż starsze kobiety o europejskim pochodzeniu są na najwyższym ryzyku.2 Gęstość kości jest jedynym najlepszym predyktorem złamań osteoporotycznych i jest cennym narzędziem w ocenie ryzyka złamań. 3.4 Istnieje wiele dowodów na genetyczny wkład w zmiany w gęstości mineralnej kości, z szacunkami odziedziczalności od 0,6 do 0,8 5 Gęstość mineralna kości zależy również od czynników środowiskowych i medycznych. Liczne geny kandydujące zostały przetestowane pod kątem ich związku z gęstością mineralną kości i ze złamaniami osteoporotycznymi, co daje zróżnicowane wyniki.6,7 Kilka analiz sprzężeń obejmujących gęstość mineralną kości jako cechę ilościową również dało zróżnicowane wyniki.8 Badanie asocjacji genomewide, test dla powiązania setek tysięcy polimorfizmów pojedynczych nukleotydów (SNP) z określonym fenotypem, daje możliwość odkrycia genów, które przyczyniają się do gęstości mineralnej kości.
Metody
Populacje badawcze
Przebadaliśmy cztery populacje: zbiór odkrycia złożony z 5861 osób islandzkich, z czego 87% to kobiety, oraz trzy zestawy replikacyjne – 4165 innych islandzkich osób (z czego 74% stanowią kobiety), 2269 kobiet po menopauzie z Danii, 9,10 i australijski Dubbo Studium Epidemiologii osteoporozy (DOES) kohorta11 z 1491 osób (61% z nich to kobiety)
[hasła pokrewne: wstęga przyśrodkowa, przeglądarka nfz, przeglądarka nfz warszawa ]