Wiele genetycznych loci dla gęstości mineralnej kości i złamań czesc 4

Jedenaście SNP z pięciu regionów chromosomalnych – 1p36, 6p21, 6q25, 8q24 i 13q14 – było związanych z gęstością mineralną kości kręgosłupa, spełniając kryteria nominalnego znaczenia w zestawach duńskich i australijskich łącznie oraz znaczenie dla całego genomu we wszystkich zestawach łącznie (Tabela 1). Na podstawie tych samych kryteriów sześć SNP z trzech regionów chromosomalnych (1 p36, 6q25 i 8q24) było związanych z gęstością mineralną kości biodrowej (Tabela 2). Te trzy loci były również związane z gęstością mineralną kości kręgosłupa. Oceniliśmy, że allele związane z niską gęstością mineralną kości spowodowały spadek o 0,05 do 0,17 wystandaryzowanej jednostki. Nie obserwowaliśmy asocjacji płciowych w żadnym z pięciu loci, z wyjątkiem 8q24, gdzie znacznie silniejszy efekt zaobserwowano u mężczyzn niż u kobiet (P = 0,03 do 0,050) (tabela 4 w dodatkowym dodatku 1).
Regiony 13q14 (RANKL), 8q24 (OPG) i 18q21 (RANK)
SNP najsilniej związane z gęstością mineralną kości kręgosłupa w zestawie odkrywczym, rs9594759 na 13q14, znajduje się 113 kb powyżej aktywatora receptora jądrowego genu ligandu czynnika .B (RANKL) i w bloku sprzężeniowo-dyspersyjnym sąsiadującym z tym genem ( Rysunek 1A w Uzupełniającym dodatku 1). Związek pomiędzy rs9594759 a gęstością mineralną kości kręgosłupa był zgodny w każdym zestawie replikacyjnym. Inny SNP, rs9594738, wybrany na podstawie danych HapMap, wykazał najsilniejsze powiązanie z gęstością mineralną kości kręgosłupa, gdy genotypowano w zestawach replikacyjnych (połączony P = 2,0 x 10-21) (tabela 1). Szacujemy, że allel T rs9594738 obniża gęstość mineralną kości kręgosłupa o 0,17 ustandaryzowanej wartości na allel. W odniesieniu do związku z gęstością mineralną kości biodrowej, ten SNP osiągnął znaczenie dla całego genomu w połączonych próbach islandzkich (tabela 2) i miał nominalnie znaczące powiązanie w zestawie duńskim, ale nie w zestawie australijskim.
Dwa skorelowane SNP na 8q24, rs6469804 i rs6993813, osiągnęły znaczenie dla genomu dla gęstości mineralnej kości kręgosłupa i kości biodrowej i były istotnie związane w zestawach replikacyjnych (Tabela i Tabela 2). Te dwa SNP wykazują silną nierównowagę sprzężeń (parami współczynnik determinacji [r2] = 0,94) i znajdują się w bloku sprzężenia i nierównowagi, w tym genu osteoprotegeryny (OPG) (rysunek 1B w dodatku uzupełniającym 1). Ten gen został przetestowany pod kątem powiązania z gęstością mineralną kości i osteoporozą, z niespójnymi wynikami.15-25 Dwa najczęściej badane SNP w tym genie, G1181 . C (rs2073618) i T950 . C (rs2073617), są w sprzężeniu nierównowagi z obydwoma rs6469804 (r2 = 0,57 i r2 = 0,77, odpowiednio) i rs6993813 (r2 = 0,44 i r2 = 0,59, odpowiednio) w zestawie danych HapMap-CEU (składającym się z obiektów Centre d Etude du Polymorphisme Humain [CEPH], którzy są mieszkańcami Utah pochodzenia północnego i zachodnioeuropejskiego). Nasze wyniki są zgodne z wynikami z poprzednich badań, w których opisano związki o gęstości mineralnej kości.16,18,22-24
Tabela 3. Tabela 3. Szacunkowy wpływ na gęstość mineralną kości kręgosłupa lub hip SNP w trzech regionach z sugerowanymi powiązaniami z mineralną gęstością kości i złamaniem. RANKL i OPG kodują znane regulatory przebudowy kości, które wraz z aktywatorem receptora jądrowego białka RBK .B mają kluczowe znaczenie dla osteoklastogenezy i aktywacji resorpcji kości
[podobne: szczotka do włosów tangle teezer allegro, sztuka dorastania cda, przeglądarka skierowań na leczenie sanatoryjne nfz ]