Wiele genetycznych loci dla gęstości mineralnej kości i złamań ad

Pomiar absorpcjometrii rentgenowskiej z dwoma energiami w odcinku lędźwiowym kręgosłupa i biodrze (całkowity pomiar szyi biodrowej lub szyjnej kości udowej) uzyskano u wszystkich pacjentów. Znormalizowana gęstość mineralna kości została obliczona i skorygowana pod względem płci, wieku i masy ciała (patrz sekcja Metody w Dodatkowym dodatku 1, dostępna wraz z pełnym tekstem tego artykułu na stronie www.nejm.org). Na przykład standaryzowana wartość X odpowiada odchyleniom standardowym X powyżej lub poniżej średniej populacji po dostosowaniu do płci, wieku i wagi. Większość złamań o niskim stopniu udaru była zgłaszana przez osoby w zestawach islandzkich; doniesienia o złamaniach biodra w tych zestawach uzyskano z dokumentacji szpitalnej. Wszystkie złamania w duńskim zestawie były zgłaszane przez samych pacjentów, a wszystkie złamania w kohorcie australijskiej zostały potwierdzone przez przegląd raportów radiograficznych. Dalszy opis charakterystyki badanych populacji znajduje się w sekcji Metody i w Tabeli w Dodatku Dodatkowym 1. Wszyscy uczestnicy wyrazili pisemną świadomą zgodę. Badanie zostało zatwierdzone przez Komisję Ochrony Danych Islandii, Krajowy Komitet Bioetyczny Islandii, Komitet Etyczny w Kopenhadze (w Danii) oraz Komitet ds. Oceny Etyki St. Vincent (w Australii).
Badanie zostało sfinansowane przez deCODE Genetics, która przechowuje dane; autorzy w Danii i Australii również przechowują dane dla tych zestawów. Siedmiu autorów branżowych i jeden autor naukowy zaprojektowali badanie, sześciu autorów branżowych przeanalizowało dane, a sześciu przygotowało manuskrypt. Sześciu autorów branżowych i dwóch autorów akademickich ręczy za kompletność i dokładność danych.
Genotypowanie
Użyliśmy Infinium HumanHap300 lub układu SNP HumanCNV370 (Illumina) do genotypowania łącznie 317 503 SNP w próbkach DNA od 5861 osób; 5858 miało pomiary gęstości mineralnej kości kręgosłupa, a 5715 miało pomiary gęstości mineralnej kości biodrowej. Późniejsza analiza została ograniczona do 301 019 SNP, które były odpowiedniej jakości (patrz sekcja Metody w Dodatkowym dodatku 1). Genotypowaliśmy SNP w zestawach replikacyjnych w deCODE Genetics przy użyciu platformy Centaurus (Nanogen) .12
Analizy asocjacyjne
Dostosowane do wieku i wagi znormalizowane wartości gęstości mineralnej kości obliczono dla każdej płci i populacji osobno (patrz sekcja Metody w Dodatkowym dodatku 1). Dla każdego SNP przeprowadzono analizę regresji liniowej z genotypem jako współzmienną dodatkową i standaryzowaną gęstością mineralną kości jako zmienną odpowiedzi, w celu zbadania asocjacji. Każdy SNP badano oddzielnie pod kątem jego związku z gęstością mineralną kości biodra i jego związkiem z gęstością mineralną kości kręgosłupa lędźwiowego. Metodę kontroli genomowej13 użyto do skorygowania wartości P i błędów standardowych dla pokrewieństwa podmiotów islandzkich w zbiorze odkryć. Kiedy zestaw do odkrycia został połączony z islandzkim zestawem obserwacji, efekt powiązania został oszacowany poprzez symulację typów genów założycielskich poprzez islandzką genealogię (patrz sekcja Metody w Dodatkowym dodatku 1). Próg dla istotności znaczenia dla genów ustalono dla wartości P mniejszej niż 1,7 x 10-7 (0,05 ÷ 301,019 SNP) dla każdego fenotypu, a próg dla replikacji ustalono dla wartości P mniejszej niż 0,05 w zestawach do replikacji.
Aby przetestować związek między implikowanymi SNP a złamaniami osteoporotycznymi, obliczono iloraz szans dla złamań osteoporotycznych o niskiej urazie u pacjentów z przypadkami w porównaniu z grupą kontrolną
[przypisy: stetoskop allegro, zaburzenie integracji sensorycznej, przeglądarka skierowań na leczenie sanatoryjne nfz ]