Wiele genetycznych loci dla gęstości mineralnej kości i złamań ad 6

Ten gen o nieznanej funkcji ulega ekspresji w kości (numer dostępu UniGene, Hs. 418966), co wskazuje na potencjalnie niezidentyfikowaną rolę w biologicznych cechach kości. Dalej od sygnału, 250 kb w kierunku przeciwnym, znajduje się gen 4 rodziny miejsca integracji bezskrzyniowatej MMTV (WNT4). Region 6p21
Jeden SNP, rs3130340, w regionie kompleksu głównej zgodności tkankowej był związany z gęstością mineralną kości kręgosłupa w zestawach replikacyjnych i w łącznej analizie ogólnej (Tabela 1). Ten SNP znajduje się poniżej niescharakteryzowanego genu 10 otwartej ramki odczytu chromosomu 6 C6orf10 (Figura 1F w Dodatku 1). To powiązanie jest słabsze niż połączenie SNP w innych loci.
Ryzyko złamania osteoporozy
Tabela 4. Tabela 4. Związek polimorfizmów pojedynczego nukleotydu (SNP) z dowolnym osteoporotycznym złamaniem o niskiej urazie. Zbadaliśmy związek między złamaniem nisko-urazowym a SNP związanymi z gęstością mineralną kości (Tabela 4). Locus 1p36 był najsilniej związany ze złamaniami. Było to istotnie związane nie tylko z szeroko zdefiniowaną grupą złamań jakiegokolwiek rodzaju, ale także indywidualnie ze złamaniami przedramion, złamaniami stawu biodrowego i złamań kręgów (Tabela 4 oraz Tabela 5 w Dodatku 1). Lokus 8q24 był również powiązany ze wszystkimi kategoriami złamania, choć nie tak silnie jak 1p36. Miejsce MHC 6p21 było istotnie związane z szeroko zdefiniowaną grupą złamań, jak również ze złamaniami stawu biodrowego i przedramienia indywidualnie (tabela 5 w dodatkowym dodatku 1). Lokus RANK 18q21 był skromnie związany ze złamaniami; loci 6q25 ESR1 i 13q14 RANKL nie były.
Niektóre loci, które nie osiągnęły znaczenia dla genomu w naszej połączonej analizie związku z gęstością mineralną kości wykazały dowody na związek ze złamaniami osteoporotycznymi (Tabela 3 i Tabela 4). Są to rs11898505, w genie nieerytrocytującym dla spektryny (SPTBN1) na chromosomie 2p16, który był związany ze złamaniami we wszystkich zestawach próbek, najmocniej ze złamaniami kręgów (tabela 5 i figura 1G w dodatkowym dodatku 1), a SNP wewnątrz i blisko do genu kodującego białko 4 zależne od receptora lipoproteinowego o niskiej gęstości (LRP4) na chromosomie 11p11 (tabela 3 i tabela 5 oraz figura 1H w dodatkowym dodatku 1).
Geny kandydujące osteoporozy
Liczne geny kandydujące zbadano pod kątem powiązania z gęstością mineralną kości i ze złamaniami osteoporotycznymi.26,27 Przyjrzeliśmy się rankingu, w naszym zestawie danych z badania skojarzeń genomewidu, 77 genów kandydujących, o których wcześniej informowano, że są związane z gęstością mineralną kości lub złamaniami oraz sąsiednie regiony (tabela 6 w dodatkowym dodatku 1). Poza ESR1, RANKL i RANK tylko dwa z tych genów miały dwa lub więcej markerów na liście 500 SNPs najbardziej istotnie związanych z gęstością mineralną kości biodrowej lub kręgosłupa: genem sklerostezy (SOST) i podrodziną receptora jądrowego 3 , grupa C, gen członka (receptor glukokortykoidowy) (NR3C1). SNP w i wokół intensywniej badanych genów VDR receptora witaminy D (1,25-dihydroksywitaminy D3) i LRP5 białka 5 receptora lipoproteinowego o niskiej gęstości były wśród 1000 SNPs najbardziej znacząco związanych z gęstością mineralną kości, podczas gdy SNP w gen kolagenu typu I.1 COL1A1 (który również był intensywnie badany) nawet nie występował w top 5000 SNPs.
Dyskusja
Przedstawiamy tutaj wyniki naszego dużego badania dotyczącego związku mineralizacji kości z genomewidem: związki z pięcioma regionami genomowymi były replikowane konsekwentnie w trzech zestawach replikacji osobników pochodzenia europejskiego (podmioty duńskie, australijskie i islandzkie)
[więcej w: przeglądarka skierowań na leczenie sanatoryjne nfz, przeglądarka skierowań na leczenie sanatoryjne, stetoskop allegro ]