Wiele genetycznych loci dla gęstości mineralnej kości i złamań ad 5

SNP (rs3018362) znajdujący się 27 kb poniżej RANK i w obrębie tego samego bloku sprzężenia między wiązaniami, w 18q21 (fig. 1C w dodatkowym dodatku 1), wykazał konsekwentne powiązanie z gęstością mineralną kości biodrowej, chociaż związek nie spełniał znaczenia dla genomu (tabela 3). Nie znaleźliśmy znaczącej interakcji między związanymi SNPs w tych trzech genach, pomimo ich ścisłego zaangażowania na poziomie białka (patrz sekcja Metody w Dodatkowym dodatku 1). Region 6q25 ESR1
Badanie asocjacyjne genomewidu ujawniło złożony wzorzec asocjacji w regionie 6q25. SNP w tym regionie wykazywały związek z gęstością mineralną kości zarówno stawu biodrowego, jak i kręgosłupa (tabela i tabela 2 oraz tabela 3 w dodatkowym dodatku 1), a wiele osób miało skromny lub minimalny brak sprzężenia (względem siebie). Żaden z tych SNP nie mógł w pełni uwzględnić powiązań. SNP obejmowały 273 kb i były rozłożone na kilka bloków sprzężeń i nierównowagi (ryc. 1D w dodatkowym dodatku 1). Żadne z dwóch znacząco powiązanych SNP zidentyfikowanych w badaniu powiązań genomewidu, rs2504063 i rs851982, nie wykazało związków z gęstością mineralną kości w nie islandzkich zestawach replikacyjnych. Łącznie, związki pomiędzy ośmioma SNP i gęstością mineralną kości kręgosłupa były konsekwentnie replikowane (Tabela 3A w Dodatkowym Załączniku 1), z czterema (rs4870044, rs1038304, rs6929137 i rs1999805) osiągającymi znaczenie dla genomu w połączonej analizie (Tabela 1). Pięć z ośmiu SNP było również związanych z gęstością mineralną kości biodrowej; dwa z tych pięciu, rs9479055 i rs4870044, osiągnęły nominalne znaczenie w duńskich i australijskich zestawach replikacyjnych i znaczeniu dla całego genomu w połączonej analizie (tabela 2). Pięć SNP ma parami wartości r2 w zakresie od 0,001 do 0,51 i są rozproszone na trzech blokach sprzężenia i nierównowagi (Figura 1B w Dodatku 1).
Żaden pojedynczy SNP nie może w pełni wyjaśnić związku z 6q25; co najmniej trzy SNP (np. rs4870044, rs1038304 i rs1999805) wydawały się wymagać rozliczenia całkowitego powiązania (patrz sekcja Metody w Dodatkowym dodatku 1). SNP rs1999805 znajduje się w intronie wariantu składania U68068 genu receptora estrogenu (ESR1). SNPs rs4870044 i rs1038304 są zlokalizowane od 44 kb do 75 kb powyżej genu, co może wpływać na regulację transkrypcji. Jednak te dwa SNP leżą w C6orf97, otwartym genie 97 otwartej ramki odczytu chromosomu 6 o nieznanej funkcji, obecnie będącym kandydatem na geny osteoporozy (Figura 1D w Suplemencie Dodatkowym 1).
Region 1p36
Dwa SNP w sprzężeniu nierównowagi na chromosomie 1p36, rs7524102 i rs6696981 (r2 = 0,73), wykazały związek zarówno z gęstością mineralną kości biodrowej, jak i gęstością mineralną kości kręgosłupa (Tabela i Tabela 2). Znacznik pokazujący silniejsze asocjacje, rs7524102, był znaczący we wszystkich populacjach badawczych, z podobnym wpływem na gęstość mineralną kości biodrowej wśród wszystkich populacji. Te SNP są umiejscowione w bloku sprzężeniowo-nierównowagowym, który nie zawiera żadnego znanego genu (Figura 1E w Suplemencie Dodatkowym 1). Najbliższym genem jest palec cynkowy i domena BTB zawierająca 40 genów (ZBTB40), znajdująca się w sąsiednim bloku blokującym sprzężenie, 80 kb w dół od sygnału
[podobne: neuryty, nerw bloczkowy, przeglądarka skierowań na leczenie sanatoryjne nfz ]